Водоросли являются типичными представителями низших споровых растений, которые обитают преимущественно в водной среде, но многие приспособились к жизни в наземных биотопах. Водоросли - гетерогенная группа, включающая ряд отделов растительного мира, из разных царств живой природы. В Вологодской области наиболее полно исследованы водоросли в экосистемах созданных водохранилищ Волго-Балтийского водного пути. Только в Шекснинском водохранилище за период 1955-1966 гг. обнаружено более 1000 видов, из которых 47% составляют зеленые водоросли (Chlorophyta), 24% - диатомовые (Bacillariophyta), 11%-сине-зеленые (Cyanophyta). Незначительное участие в составе принимают водоросли из других отделов: золотистые (Chrysophyta), желто-зеленые (Xanthophyta), криптофитовые (Cryptophyta), а из отдела красных водорослей (Rhodophyta) в области обнаружен только один вид. Указать примерное количество видов в каждом отделе и оценить их редкость не представляется возможным ввиду недостатка данных по альгофлоре области, поэтому в Красную книгу включены только три вида из отделов: Cyanophyta, Chlorophyta, Rhodophyta, которые охраняются на сопредельных территориях и являются редкими в области.
Гетероциты - клетки, служащие для фиксации азота и отличающиеся от обычных вегетативных клеток более толстой клеточной стенкой, еще более утолщенной в местах сочленения с соседними клетками, равномерной окраской.
Гонимобласты - специальные спорогенные нити из небольшого числа клеток, которые образуются после оплодотворения.
Моноспорангии - клетки слоевища, служащие для образования одной споры (моноспоры).
Ризоиды — однорядные нитевидные образования из длинных узких клеток с толстыми оболочками.
Трихомы - нитевидные образования, состоящие из 1-2 или многих рядов физиологически взаимосвязанных клеток.