Внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под № 1542.  Решение комитета самоуправления Сямженского муниципального района от 29.06.2004 г. № 49 «О внесении изменений в решение комитета самоуправления Сямженского муниципального района от 28.04.2003 г. № 159 «О флаге Сямженского муниципального района». Флаг Сямженского муниципального района представляет собой полотнище с отношением ширины к длине 2:3. Символика флага Сямженского муниципального района воспроизводит символику герба района без короны и вольной части.